More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2293 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2293  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 329 aa  666    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  48.63 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  38.56 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  28.2 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  24.52 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 		 740 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 868 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 419 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  31.84 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  35.59 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  31.16 
 
 		 650 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  33 
 
 		 649 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 401 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 		 402 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 		 1237 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 421 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 861 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 608 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0886  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.286498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 419 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 448 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 		 418 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 421 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 		 212 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 420 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 421 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 420 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 420 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 388 aa  89  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4291  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0506003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.95 
 
 		 404 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 404 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 1171 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  31.33 
 
 		 563 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  29.94 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3923  metal dependent phophohydrolase  34.64 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.0260146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 		 362 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 		 420 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  32.11 
 
 		 410 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 431 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 420 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 		 491 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 420 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 		 345 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 		 357 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 379 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 465 aa  85.9  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>