More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0622 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0622  alkaline phosphatase  100 
 
 		 439 aa  917    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.898935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  29.48 
 
 		 488 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  27.76 
 
 		 448 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.13 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  25.44 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  28.13 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  25.84 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  25.67 
 
 		 431 aa  123  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  25.75 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  24.45 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  24.33 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  23.8 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  24.23 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  24.56 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  22.93 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  23.96 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  23.48 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  25.14 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  23.86 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  25.5 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  22.87 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  25.76 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  22.98 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  22.43 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  23.69 
 
 		 418 aa  99.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  23.73 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  21.16 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  24.72 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 350 aa  98.2  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  25.59 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  23.72 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 		 395 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  24.5 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  24.93 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  23.22 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  22.59 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  23.1 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  23.37 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 372 aa  93.6  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1614  metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 		 331 aa  93.2  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  23.66 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 		 758 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  22.07 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  22.28 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 396 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  22.25 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  22.25 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  22.25 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  22.25 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  22.25 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  22.4 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  24.32 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  22.25 
 
 		 421 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  22.62 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  22.41 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  24.41 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 364 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  22.2 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 		 593 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  34.39 
 
 		 599 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  20.57 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  19.95 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>