More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1328 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1328  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
268 aa  533  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0726  metal dependent phosphohydrolase  51.54 
 
 
269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0190  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0188  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.691401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  35.24 
 
 
770 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
465 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
513 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 
1313 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
463 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
718 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
651 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  33.04 
 
 
1333 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 
652 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  36.09 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 
1171 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
350 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  35.15 
 
 
550 aa  106  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
553 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  33.16 
 
 
563 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
471 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1822  putative metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
187 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
388 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.12 
 
 
880 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 
374 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
371 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.12 
 
 
860 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
648 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
498 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
363 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 
615 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  36.05 
 
 
382 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
428 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  29.63 
 
 
414 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  32.62 
 
 
564 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 
758 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 
201 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
343 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  33.71 
 
 
600 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
506 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
428 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
210 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 
331 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 
502 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
508 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
618 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  32.16 
 
 
431 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  28.77 
 
 
356 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
432 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
444 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
593 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  33.16 
 
 
384 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 
451 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 
912 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0097  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 
319 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
197 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
471 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
518 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  29.55 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1613  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
487 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350204  hitchhiker  0.000130728 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  28.46 
 
 
334 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
496 aa  99.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 
548 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.93 
 
 
561 aa  99  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
385 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5280  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.273072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3636  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
435 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176884  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 
462 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  36.42 
 
 
599 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 
448 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
438 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
719 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
378 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
199 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2945  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
377 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
487 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  29.3 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  30.18 
 
 
619 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
212 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 
611 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
428 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  30.9 
 
 
649 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3290  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
202 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
369 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
369 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
177 aa  95.9  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
483 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
683 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  32.63 
 
 
373 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 
331 aa  95.5  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
368 aa  95.5  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
448 aa  95.5  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
545 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1836  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
210 aa  95.1  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
373 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 
650 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
343 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>