More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3290 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3290  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2293  metal dependent phosphohydrolase  54.44 
 
 
201 aa  201  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1725  metal dependent phosphohydrolase  51.63 
 
 
207 aa  187  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1200  metal dependent phosphohydrolase  43 
 
 
203 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  0.101307 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.71 
 
 
343 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.34 
 
 
880 aa  151  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.34 
 
 
860 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
471 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  42.25 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.58 
 
 
496 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  42.77 
 
 
1313 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
651 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 
1073 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  40.32 
 
 
876 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
718 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 
513 aa  144  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
427 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 
611 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  42.11 
 
 
1333 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
247 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.86 
 
 
833 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 
836 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 
960 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 
487 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 
547 aa  141  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 
547 aa  141  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 
248 aa  141  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 
770 aa  140  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  37.22 
 
 
414 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.68 
 
 
683 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  41.9 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0097  putative PAS/PAC sensor protein  41.57 
 
 
319 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
508 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
438 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  41.42 
 
 
428 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  39.89 
 
 
561 aa  138  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 
481 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.33 
 
 
755 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  39.23 
 
 
836 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  40.83 
 
 
428 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
462 aa  137  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
363 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
331 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 
814 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 
561 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 
430 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
348 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 
317 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  40.34 
 
 
599 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 
317 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.44 
 
 
498 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 
432 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  41.71 
 
 
334 aa  135  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.83 
 
 
338 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.89 
 
 
841 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 
506 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
617 aa  134  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
698 aa  134  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  45.11 
 
 
861 aa  134  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
652 aa  134  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
553 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
615 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
379 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 
1237 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 
545 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 
868 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.67 
 
 
792 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  39.58 
 
 
349 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
357 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  36.31 
 
 
563 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 
483 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
338 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
338 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  39.77 
 
 
619 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  39.88 
 
 
340 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 
648 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 
618 aa  132  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
346 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
212 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.67 
 
 
853 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  35.96 
 
 
550 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 
502 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
350 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 
758 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4405  metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 
186 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 
353 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
505 aa  131  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.25 
 
 
1171 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
442 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 
593 aa  131  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2325  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 
362 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.663275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  39.88 
 
 
334 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
420 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
428 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  34.21 
 
 
564 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
348 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>