More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2293 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2293  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3290  metal dependent phosphohydrolase  54.44 
 
 
202 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1725  metal dependent phosphohydrolase  51.55 
 
 
207 aa  187  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  45.76 
 
 
651 aa  153  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 
471 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1200  metal dependent phosphohydrolase  45.35 
 
 
203 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  0.101307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
1313 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  43.18 
 
 
1333 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 
438 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
718 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  43.83 
 
 
525 aa  141  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
462 aa  141  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.91 
 
 
860 aa  141  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.91 
 
 
880 aa  140  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 
513 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2105  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.21 
 
 
525 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173233  normal  0.407049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
343 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
547 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
547 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2004  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 
525 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0562345  hitchhiker  0.000000282251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1971  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 
525 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0825869  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.24 
 
 
853 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 
331 aa  137  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 
247 aa  137  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
220 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  39.27 
 
 
1171 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.42 
 
 
343 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
368 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
1073 aa  135  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
553 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  38.95 
 
 
649 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  39.55 
 
 
836 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 
512 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.61 
 
 
960 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 
508 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.68 
 
 
496 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 
487 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
561 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  38.42 
 
 
428 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  43.9 
 
 
384 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  40.12 
 
 
650 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 
617 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.3 
 
 
876 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2945  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 
377 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  39.11 
 
 
632 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
363 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 
420 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  39.58 
 
 
740 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  38.74 
 
 
212 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.15 
 
 
348 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  43.58 
 
 
371 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1789  response regulator receiver protein  42.59 
 
 
524 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101023  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
833 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  37.84 
 
 
349 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.64 
 
 
841 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 
1237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
331 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
331 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 
861 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
618 aa  131  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2325  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.54 
 
 
362 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.663275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
354 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 
471 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 
347 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4485  hypothetical protein  39.51 
 
 
523 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 
523 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  40.22 
 
 
334 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 
428 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.89 
 
 
1338 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  39.29 
 
 
351 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  40.22 
 
 
334 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
428 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
868 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2212  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.16257  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2172  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0465103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
836 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  39.01 
 
 
326 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  38.3 
 
 
718 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2222  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.151758  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
539 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  41.57 
 
 
606 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.18 
 
 
971 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
331 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
571 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
758 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.25 
 
 
367 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 
463 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2427  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
521 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000118537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  39.18 
 
 
561 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
502 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
334 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  41.18 
 
 
338 aa  128  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
331 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  39.25 
 
 
373 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.6 
 
 
432 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 
306 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.76 
 
 
792 aa  127  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
420 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 
611 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>