More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5833 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 489 aa  973    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 515 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  64.48 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  64.48 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  61.27 
 
 		 522 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  50.82 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 526 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 		 526 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  32.47 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 519 aa  207  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 		 521 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 525 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  25 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  24.94 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  23.63 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  23.67 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  31.82 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  23.45 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  32.5 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  22.7 
 
 		 347 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 		 392 aa  90.5  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 770 aa  90.1  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 648 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  29.28 
 
 		 415 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 		 177 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 480 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 311 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 615 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 635 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 320 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 		 574 aa  87  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  23.96 
 
 		 545 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 618 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 		 364 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  27.78 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  21.77 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.89 
 
 		 841 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  29.1 
 
 		 792 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  28.42 
 
 		 836 aa  80.1  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 631 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 320 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  24.65 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  29.07 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.49 
 
 		 860 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.49 
 
 		 880 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  27.33 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  29.14 
 
 		 619 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>