More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6692 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  95.92 
 
 		 515 aa  931    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 570 aa  1127    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 570 aa  1127    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  63.71 
 
 		 489 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  57.09 
 
 		 522 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  50.2 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 		 519 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 		 519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  33.86 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 526 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  31.99 
 
 		 524 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 		 450 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  25 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  23.09 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  24.57 
 
 		 461 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  21.73 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  27.12 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  24.23 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  24.92 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0697  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  27.66 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  22.95 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1355  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  27.88 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  30.52 
 
 		 836 aa  75.1  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 648 aa  75.5  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  30.52 
 
 		 792 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.52 
 
 		 841 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 471 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  31.74 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0230  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000415135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  21.36 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 618 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 210 aa  70.1  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  32.67 
 
 		 793 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 770 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  23.96 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 		 320 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 553 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 		 196 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  22.86 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  31.1 
 
 		 848 aa  66.6  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 424 aa  67  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  29.22 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  28.65 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  25.42 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  21.6 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  26.42 
 
 		 294 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  28.05 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  29.53 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>