More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0476 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 323 aa  656    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  41.18 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  33.44 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  36 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  29.09 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  32.73 
 
 		 335 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 328 aa  95.9  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  27.19 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  31.7 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.7 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  29.37 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  25.85 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  26.91 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.69 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 140 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 220 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3900  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 592 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 477 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.9 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  45.16 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  45 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  40.91 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.9 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 112 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 240 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 229 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 247 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 211 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 206 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.83 
 
 		 919 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5649  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.090782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  34.92 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 471 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3116  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  49.06 
 
 		 878 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1881  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  44.26 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>