40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0794 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 337 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  37.31 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  36.23 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  32.73 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  31.55 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  30.68 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  31.4 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  28.74 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  35.47 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  28.83 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  27.49 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  25.94 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  25.57 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.72 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  26.2 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  60.78 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  30.46 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  38.68 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  59.09 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 112 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  29.48 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  25.16 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  26.06 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 477 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.5 
 
 		 251 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>