76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0315 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 337 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  46.08 
 
 		 324 aa  255  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  39.88 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  42.25 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  36.75 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  34.32 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  36.79 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  35.24 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  34.91 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  37.23 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  31.49 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  30.38 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  36.03 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.84 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  27.86 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  32.35 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  29.74 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  25.61 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  31.13 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 477 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 112 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 142 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  40.91 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2537  transcriptional antiterminator, BglG  54.35 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  25.95 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.94 
 
 		 220 aa  46.2  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.57 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3065  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0295  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  28.42 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.88 
 
 		 226 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7175  transcriptional regulator, LuxR family  34.52 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5411  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5740  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 240 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  31.17 
 
 		 188 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  32.81 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 240 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1767  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 248 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.426334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 211 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 222 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  31.58 
 
 		 222 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>