136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0188 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 341 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 385 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  34.65 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  33.7 
 
 		 340 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 112 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  29.76 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3222  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  30 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  32.26 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3420  LuxR family DNA-binding response regulator  33.85 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  33.85 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0800  transcriptional regulator, LuxR family protein  31.87 
 
 		 130 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1690  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 204 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 781 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  27.5 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1009  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.43 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 919 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  37.33 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.08 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  31.9 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  45.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3716  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 443 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2824  transcriptional regulator, LuxR response regulator receiver  26.37 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2959  LuxR response regulator receiver  46.03 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  45 
 
 		 74 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  44.07 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0846  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 74 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  44.9 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0937  LuxR family DNA-binding response regulator  31.43 
 
 		 223 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4385  germination protein GerE  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4226  germination protein  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 921 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  38.98 
 
 		 921 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  38.98 
 
 		 921 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 323 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4329  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4629  germination protein GerE  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4609  germination protein GerE  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0626  germination protein GerE  41.43 
 
 		 74 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>