285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0418 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  54.69 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  53.33 
 
 		 340 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  59.68 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  53.33 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 477 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 244 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 191 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 341 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  51.79 
 
 		 330 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 236 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  38.75 
 
 		 332 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 328 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 336 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 250 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 323 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  43.06 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  43.06 
 
 		 321 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 246 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 248 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.41 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 216 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2019  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 223 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  35.94 
 
 		 213 aa  47.4  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  27.35 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  27.35 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  32.56 
 
 		 210 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1373  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  52.08 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  27.35 
 
 		 224 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 216 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 337 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4005  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 213 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  29.35 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.83 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2104  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 328 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  43.64 
 
 		 285 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 204 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  46.43 
 
 		 324 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 225 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  39.34 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  46.3 
 
 		 323 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.52 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.36 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 245 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2513  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 233 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>