More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1421 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 365 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  39.24 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  38.41 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  34.93 
 
 		 340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  37.54 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  32.72 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  31.04 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  30.47 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  30.59 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  30.88 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  31.07 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 339 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 317 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  29.64 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  29.41 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  28.98 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.97 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  31.78 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.26 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 477 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  40.41 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  32.27 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 112 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.66 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  32.17 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  32.52 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 228 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3878  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 200 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 220 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3981  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.347336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 238 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3800  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3921  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3813  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0370  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.07 
 
 		 227 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 219 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  34.21 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 218 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 247 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 211 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 241 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 246 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 917 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  43.33 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  33.77 
 
 		 221 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  39.34 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.45 
 
 		 873 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 221 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  37.63 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  36.23 
 
 		 233 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.19 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7175  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  27.42 
 
 		 243 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>