122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3886 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 326 aa  634    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  35.49 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  36.28 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  33.84 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  32.72 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  34.58 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  31.72 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  31.5 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  31.72 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  31.33 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  35.52 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 385 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.52 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  29.08 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  27.61 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  32.53 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  29.01 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 112 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 211 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 123 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 118 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2880  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 127 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0642164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 213 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 217 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.26 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  40.58 
 
 		 207 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 212 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5374  two component response regulator  38.33 
 
 		 779 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  38.6 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  39.44 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 188 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3065  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 500 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 226 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4369  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 102 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 200 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 200 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 200 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 231 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  41.18 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 200 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 200 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>