100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2593 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  87.31 
 
 		 323 aa  544  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 365 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  32.37 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  29.39 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  28.48 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  31.76 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  30.33 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  30.07 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8191  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.27 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  28.22 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  29.76 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  28.91 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.5 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  33.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  25.91 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  24.91 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  31.79 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  42.25 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0794  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  40.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03610  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.94 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.166414  normal  0.0491532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 213 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 541 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 221 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4547  transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 112 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  39.34 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1275  regulatory protein, LuxR  37.04 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.720232  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.73 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 535 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  32.79 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  30 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 477 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 198 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  33.73 
 
 		 243 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  34.92 
 
 		 221 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  34.92 
 
 		 221 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  21.96 
 
 		 275 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0828  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00513824  normal  0.360671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 226 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4608  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 275 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  33.82 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 246 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 225 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3808  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706178  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 223 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 231 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 251 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0316  LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 216 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0978  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 247 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.159022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3104  transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 142 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 229 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>