More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0238 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  46.12 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0166  hypothetical protein  55.06 
 
 		 126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0165  LuxR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 79 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2265  LuxR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.62 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  42.65 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  51.61 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  46.03 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  43.1 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  40 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1895  putative transcription regulator protein  33.83 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.030885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  48.15 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  49.09 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1858  regulatory protein, LuxR  49.09 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.968511  normal  0.429654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 922 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  50 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  53.06 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  46.3 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  50 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  48.15 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  48.98 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  47.17 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  27.5 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 904 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  40.79 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2048  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0912162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.76 
 
 		 867 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1953  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  53.85 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>