More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1874 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  70.08 
 
 		 262 aa  351  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0166  hypothetical protein  38.82 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0165  LuxR family transcriptional regulator  66 
 
 		 79 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  48.48 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2265  LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  44.59 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  43.94 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  44.59 
 
 		 917 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  43.59 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  43.33 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1248  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  43.33 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  29.13 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  49.12 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  42.42 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  45 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5553  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 373 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.36 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 924 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>