More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3341 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  68.89 
 
 		 161 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  51.95 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.4 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 307 aa  72  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  58.93 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.27 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  63.27 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  51.72 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.75 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.58 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  62.75 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.75 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  51.79 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  59.62 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  52.63 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0523  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 122 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  50 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  45.9 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5553  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3149  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  54.39 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  46.55 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.45 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 864 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0116  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 799 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  47.46 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  52.73 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  40.26 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  29.75 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4301  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  53.12 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4897  response regulator receiver  50.88 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275297  normal  0.216824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>