More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0523 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0523  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 122 aa  234  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 339 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 305 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 309 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  48.44 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 292 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 301 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  55.32 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  44.07 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  46.75 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 306 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 309 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 		 301 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  39.8 
 
 		 300 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  34.78 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 311 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 353 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  33.71 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 361 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  34.78 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  47.06 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1702  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139777  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 301 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5553  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 373 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 954 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  44.26 
 
 		 214 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 394 aa  53.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 305 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 312 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 312 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 312 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5387  autoinducer-binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.841269  normal  0.0379322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 253 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 234 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 247 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 251 aa  50.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 247 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 247 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 864 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 227 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 461 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 216 aa  50.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 239 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  40.96 
 
 		 206 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 294 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.86 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 243 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  48 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.06 
 
 		 925 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1307  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 492 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 		 516 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>