More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3395 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  35.46 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  29.51 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  29.51 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  32.13 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  31.02 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  36.02 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  25.1 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  30.58 
 
 		 236 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.29 
 
 		 213 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  32.24 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  32.24 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  32.24 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.24 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  28.24 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  31.84 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.87 
 
 		 239 aa  96.3  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  26.89 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 242 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  30.87 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.83 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  30.87 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.83 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.87 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.83 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.87 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.87 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.83 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.87 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.83 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.87 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.42 
 
 		 394 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 228 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 228 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  29.8 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 250 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0066  LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.961932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  28.74 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.88 
 
 		 425 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  24.29 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 235 aa  90.1  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  28.22 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 239 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.16 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  28.19 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 239 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5387  autoinducer-binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.841269  normal  0.0379322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.91 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.4 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>