More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2294 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  46.24 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 916 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 894 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 1085 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 514 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 514 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  58.33 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 882 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 496 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 349 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 496 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2485  transcriptional regulator, LuxR family  57.89 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 901 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 1137 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  35.48 
 
 		 896 aa  55.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  45.76 
 
 		 1085 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 956 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.48 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 929 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 353 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.94 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 950 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2895  response regulator of salavaricin regulon  33.33 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0430888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.19 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17000  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.79 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  51.79 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 755 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  47.27 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.59 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  45.59 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2146  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.208263  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 356 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  41.79 
 
 		 90 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 128 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 497 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 336 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>