More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1292 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 845 aa  1664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 926 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  28.52 
 
 		 893 aa  243  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 894 aa  233  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 907 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  26.88 
 
 		 912 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  27.05 
 
 		 908 aa  122  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  29.6 
 
 		 903 aa  108  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 864 aa  100  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 910 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 868 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  30.45 
 
 		 867 aa  97.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  26.86 
 
 		 880 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 879 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  29.43 
 
 		 865 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 871 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  24.47 
 
 		 893 aa  79.7  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  27.02 
 
 		 884 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  26.43 
 
 		 562 aa  67  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 884 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  36.03 
 
 		 876 aa  67  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  31.01 
 
 		 1001 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  35.56 
 
 		 893 aa  62.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 910 aa  63.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 998 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 974 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.55 
 
 		 881 aa  61.2  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 929 aa  60.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 903 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  52.38 
 
 		 961 aa  60.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 189 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 959 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 909 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 956 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  52.46 
 
 		 955 aa  60.1  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.04 
 
 		 937 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 894 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 937 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.04 
 
 		 937 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 936 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  33.74 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  58.49 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  51.92 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 876 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 889 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 755 aa  58.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 929 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  29.78 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  46.43 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  51.79 
 
 		 917 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 928 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 877 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  52 
 
 		 567 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  26.42 
 
 		 788 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 953 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  49.09 
 
 		 934 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 916 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 211 aa  56.6  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 960 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 856 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 204 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 900 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 204 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.11 
 
 		 862 aa  55.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 882 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 1074 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 943 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 919 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  52.73 
 
 		 919 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  52.73 
 
 		 919 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  32.3 
 
 		 690 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  56.25 
 
 		 884 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 1052 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  32.3 
 
 		 690 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.09 
 
 		 215 aa  55.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  35.23 
 
 		 337 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 491 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 865 aa  54.3  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  58.33 
 
 		 963 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  31.21 
 
 		 640 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  49.02 
 
 		 776 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 231 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 1104 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.9 
 
 		 907 aa  53.9  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 956 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  31.68 
 
 		 690 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 997 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 231 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 191 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 905 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 680 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>