More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2146 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2146  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.208263  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  25.1 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  24.29 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.78 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.59 
 
 		 914 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  49.09 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  53.7 
 
 		 906 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  53.7 
 
 		 906 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  47.76 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  36.61 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  46.43 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 496 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  55.77 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 496 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  38.64 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  47.37 
 
 		 904 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  41.79 
 
 		 921 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.17 
 
 		 921 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.17 
 
 		 921 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.17 
 
 		 921 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  45.59 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 924 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.31 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.532687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.05 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  40.32 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.03 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  41.77 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  37.84 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.3 
 
 		 1019 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  41.54 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.37 
 
 		 922 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  39.53 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 426 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  50.94 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  45.33 
 
 		 839 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  41.25 
 
 		 913 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  44 
 
 		 914 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  52.83 
 
 		 873 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  43.64 
 
 		 887 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35 
 
 		 913 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  39.39 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.79 
 
 		 877 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  50 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 87 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>