More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2644 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  56.71 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  49.57 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  42.39 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2146  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  25.1 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.208263  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0669  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  25.33 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  33.05 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.06 
 
 		 938 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 927 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  40.24 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  32.04 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 923 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0691  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  41.79 
 
 		 960 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 928 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.645513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  47.17 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  37.36 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 993 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 		 995 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 824 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.74 
 
 		 824 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 1000 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 894 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.18 
 
 		 923 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  42.31 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 1089 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.66 
 
 		 1235 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 		 937 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 946 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 936 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  49.06 
 
 		 943 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.68 
 
 		 1383 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.37 
 
 		 867 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 835 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  44.44 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  41.67 
 
 		 892 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 937 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  41.51 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  40.91 
 
 		 937 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0611  regulatory protein, LuxR  37.97 
 
 		 878 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000972895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  41.86 
 
 		 916 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  40.91 
 
 		 937 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 895 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  42.19 
 
 		 928 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 134 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>