More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2254 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  71.62 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  52.36 
 
 		 239 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  52.99 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0669  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  27.5 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2146  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.208263  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 814 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 927 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 		 932 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 938 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  28.65 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 781 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.93 
 
 		 850 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40 
 
 		 955 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 895 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  44 
 
 		 887 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 947 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 956 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.94 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  37.21 
 
 		 961 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 929 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  45 
 
 		 776 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 435 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  52.73 
 
 		 827 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  45.76 
 
 		 1001 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 486 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 923 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 908 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  39.51 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  49.06 
 
 		 893 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 904 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 901 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 956 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 925 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 862 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  43.64 
 
 		 919 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  47.46 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  45 
 
 		 879 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  41.82 
 
 		 896 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 119 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.55 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 876 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 550 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 894 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  43.64 
 
 		 921 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 973 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>