More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  96.46 
 
 
924 aa  1705    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  100 
 
 
901 aa  1801    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  70.29 
 
 
904 aa  1214    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  30.26 
 
 
907 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
907 aa  294  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  30.21 
 
 
907 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.41 
 
 
947 aa  269  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.03 
 
 
1019 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  25.19 
 
 
887 aa  250  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  28.48 
 
 
900 aa  248  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.91 
 
 
910 aa  244  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 
906 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
914 aa  240  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.09 
 
 
913 aa  237  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.33 
 
 
922 aa  234  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  29.46 
 
 
906 aa  233  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
904 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.54 
 
 
930 aa  229  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.21 
 
 
921 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.21 
 
 
921 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.85 
 
 
897 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.15 
 
 
921 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.35 
 
 
901 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.22 
 
 
1021 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  26.23 
 
 
913 aa  221  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.01 
 
 
880 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.16 
 
 
913 aa  218  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.49 
 
 
911 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.17 
 
 
876 aa  217  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.59 
 
 
930 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
921 aa  215  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.57 
 
 
924 aa  214  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.44 
 
 
1003 aa  213  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.24 
 
 
894 aa  210  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  24.97 
 
 
878 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.94 
 
 
917 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  28.45 
 
 
824 aa  208  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.93 
 
 
867 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  30.8 
 
 
914 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  29.72 
 
 
896 aa  202  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  26.01 
 
 
921 aa  201  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
947 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  32.4 
 
 
920 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.89 
 
 
877 aa  197  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.62 
 
 
896 aa  194  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  30.78 
 
 
910 aa  194  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.44 
 
 
925 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.09 
 
 
914 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.72 
 
 
889 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.15 
 
 
914 aa  188  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  27.34 
 
 
902 aa  187  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  32.24 
 
 
905 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.17 
 
 
905 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.15 
 
 
758 aa  185  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
905 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  26.27 
 
 
902 aa  184  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.67 
 
 
870 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.7 
 
 
905 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  27.43 
 
 
919 aa  180  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
916 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  25.93 
 
 
914 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  32.11 
 
 
749 aa  170  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  28.17 
 
 
921 aa  167  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  27.42 
 
 
901 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  27.42 
 
 
902 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  27.42 
 
 
901 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  27.42 
 
 
901 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  28.23 
 
 
901 aa  163  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.72 
 
 
766 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  29.34 
 
 
903 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  27.22 
 
 
901 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  29.34 
 
 
903 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  25.76 
 
 
1336 aa  162  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.76 
 
 
932 aa  162  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.67 
 
 
935 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.27 
 
 
901 aa  160  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  25.88 
 
 
899 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  25.24 
 
 
901 aa  159  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.07 
 
 
901 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.23 
 
 
905 aa  156  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.44 
 
 
900 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  26.87 
 
 
901 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.87 
 
 
901 aa  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  26.87 
 
 
901 aa  155  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  26.87 
 
 
901 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.58 
 
 
901 aa  155  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  26.87 
 
 
901 aa  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  26.87 
 
 
901 aa  155  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  33.5 
 
 
911 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  28.34 
 
 
904 aa  154  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.57 
 
 
860 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  31.74 
 
 
1097 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  25.6 
 
 
944 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.94 
 
 
947 aa  146  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.55 
 
 
933 aa  144  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  31.77 
 
 
732 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.87 
 
 
884 aa  141  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 
896 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.63 
 
 
907 aa  140  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  35.23 
 
 
919 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>