More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1523 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  100 
 
 
873 aa  1600    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.71 
 
 
1021 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  32.05 
 
 
900 aa  171  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.45 
 
 
897 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  22.23 
 
 
921 aa  131  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  25 
 
 
887 aa  130  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.16 
 
 
876 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.3 
 
 
913 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.4 
 
 
953 aa  121  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  30.5 
 
 
900 aa  117  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.95 
 
 
766 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.88 
 
 
910 aa  114  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.76 
 
 
877 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.51 
 
 
884 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  27 
 
 
896 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  26.16 
 
 
878 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27.65 
 
 
916 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.99 
 
 
870 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.47 
 
 
867 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.38 
 
 
1019 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.66 
 
 
1003 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.66 
 
 
904 aa  99.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.25 
 
 
924 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.56 
 
 
902 aa  97.8  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.25 
 
 
903 aa  97.8  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.25 
 
 
903 aa  97.8  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  24.22 
 
 
901 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  24.22 
 
 
901 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.56 
 
 
932 aa  97.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.46 
 
 
901 aa  96.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  23.32 
 
 
902 aa  96.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.16 
 
 
911 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  24.04 
 
 
901 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.04 
 
 
901 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  23.73 
 
 
901 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  24.04 
 
 
901 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
914 aa  95.1  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.48 
 
 
935 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.17 
 
 
921 aa  94.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.17 
 
 
921 aa  94.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  31.13 
 
 
913 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.72 
 
 
922 aa  94  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.17 
 
 
921 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  23.87 
 
 
901 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.25 
 
 
840 aa  93.6  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  23.56 
 
 
901 aa  94  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.04 
 
 
914 aa  93.2  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  29.58 
 
 
888 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 
906 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  23.76 
 
 
901 aa  92  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.57 
 
 
930 aa  91.3  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33 
 
 
955 aa  91.3  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.25 
 
 
921 aa  91.3  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  27.52 
 
 
906 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.48 
 
 
880 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.75 
 
 
897 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.86 
 
 
899 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  27.42 
 
 
913 aa  89  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.73 
 
 
758 aa  89  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  36.78 
 
 
824 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  23.29 
 
 
901 aa  88.6  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  23.29 
 
 
901 aa  88.6  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  23.29 
 
 
901 aa  88.6  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  26.32 
 
 
920 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  23.29 
 
 
902 aa  88.2  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  29.09 
 
 
904 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  28.79 
 
 
919 aa  88.2  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 
888 aa  87.8  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  23.06 
 
 
901 aa  87.8  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.91 
 
 
947 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.47 
 
 
914 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.51 
 
 
730 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  22.06 
 
 
901 aa  85.9  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
947 aa  85.5  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.86 
 
 
905 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  25.22 
 
 
894 aa  84.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.07 
 
 
854 aa  83.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.78 
 
 
917 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  25.31 
 
 
1000 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  30.05 
 
 
911 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  24.03 
 
 
1110 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  25.64 
 
 
1082 aa  82  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.11 
 
 
905 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 
901 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.23 
 
 
924 aa  80.9  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  26.04 
 
 
905 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.87 
 
 
894 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.85 
 
 
947 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  28.26 
 
 
717 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  24.83 
 
 
914 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.94 
 
 
1235 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  24.54 
 
 
910 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  40.94 
 
 
891 aa  77.8  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
905 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.34 
 
 
914 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.6 
 
 
900 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.66 
 
 
889 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  63.93 
 
 
1383 aa  74.3  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  29.26 
 
 
1095 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
253 aa  73.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>