More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3120 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  100 
 
 
854 aa  1664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36550  ATP-dependent transcriptional regulator  30.31 
 
 
846 aa  204  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123072  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3217  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.52 
 
 
891 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000769208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  33.95 
 
 
992 aa  95.9  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.93 
 
 
910 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.97 
 
 
884 aa  81.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2065  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.96 
 
 
838 aa  79  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  21.24 
 
 
916 aa  79  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.69 
 
 
932 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.83 
 
 
924 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  24.43 
 
 
907 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 
867 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.91 
 
 
897 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  21.04 
 
 
921 aa  69.7  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 
906 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  54.79 
 
 
868 aa  68.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.03 
 
 
900 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.11 
 
 
1003 aa  67.8  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.24 
 
 
873 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.66 
 
 
846 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  26.58 
 
 
906 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  27.29 
 
 
900 aa  65.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.37 
 
 
930 aa  65.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4102  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.88 
 
 
859 aa  65.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  25.64 
 
 
695 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.9 
 
 
914 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  23.22 
 
 
894 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.1 
 
 
758 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0047  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 
80 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284313  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  23.93 
 
 
896 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  51.56 
 
 
840 aa  61.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  22.02 
 
 
887 aa  61.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  24.4 
 
 
907 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0096  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
78 aa  60.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  29.66 
 
 
824 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0182  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
85 aa  60.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
146 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  25.71 
 
 
900 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.86 
 
 
824 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0429  regulatory protein, LuxR  24.39 
 
 
884 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.81 
 
 
930 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  28.35 
 
 
855 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  46.51 
 
 
895 aa  58.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  55.74 
 
 
212 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  46.38 
 
 
286 aa  57.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.57 
 
 
900 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 
907 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.69 
 
 
899 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 
250 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  23.42 
 
 
914 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 
217 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 
208 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  50.79 
 
 
1336 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.81 
 
 
894 aa  55.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  43.08 
 
 
216 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  50 
 
 
896 aa  55.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.94 
 
 
1021 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
227 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.72 
 
 
953 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
309 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  42.65 
 
 
496 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.54 
 
 
1235 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  26.69 
 
 
756 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 
217 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
799 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  27.59 
 
 
868 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 
501 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
461 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
272 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 
462 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 
228 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  22.8 
 
 
902 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  40.45 
 
 
861 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0833  regulatory protein, LuxR  22.9 
 
 
904 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 
211 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.43 
 
 
907 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 
221 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4301  transcriptional regulator, LuxR family  36.72 
 
 
261 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 
1019 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
216 aa  52.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.13 
 
 
230 aa  52.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  46.77 
 
 
933 aa  52.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.96 
 
 
766 aa  52.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
368 aa  52.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  24.82 
 
 
1145 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  22.7 
 
 
913 aa  52  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  25.37 
 
 
920 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  23.24 
 
 
902 aa  52  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3022  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  48.08 
 
 
485 aa  52  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  24.12 
 
 
1204 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.18 
 
 
221 aa  51.6  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 
1383 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.23 
 
 
905 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.71 
 
 
897 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  46.77 
 
 
471 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
238 aa  51.6  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 
223 aa  51.2  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
253 aa  51.6  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 
472 aa  51.2  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
514 aa  51.2  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>