105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4102 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4102  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  100 
 
 		 859 aa  1739    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  28.68 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36550  ATP-dependent transcriptional regulator  25.32 
 
 		 846 aa  76.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3217  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.98 
 
 		 891 aa  69.3  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000769208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 914 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.57 
 
 		 913 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.88 
 
 		 854 aa  65.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  24.54 
 
 		 921 aa  62.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.07 
 
 		 902 aa  62.4  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.02 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.86 
 
 		 910 aa  60.8  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  25.24 
 
 		 921 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.81 
 
 		 873 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  25.07 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.01 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.98 
 
 		 1021 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  22.91 
 
 		 901 aa  57.4  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.47 
 
 		 921 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.47 
 
 		 921 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.47 
 
 		 921 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.7 
 
 		 749 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 236 aa  55.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  23.63 
 
 		 903 aa  55.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  23.63 
 
 		 903 aa  55.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.2 
 
 		 902 aa  55.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  23.79 
 
 		 904 aa  55.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.8 
 
 		 897 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 237 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 237 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  41.24 
 
 		 992 aa  54.3  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  24.68 
 
 		 913 aa  53.9  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 208 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.37 
 
 		 234 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  22.31 
 
 		 901 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 222 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 253 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.96 
 
 		 234 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 250 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 238 aa  50.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.24 
 
 		 877 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 216 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 219 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.25 
 
 		 894 aa  50.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 303 aa  50.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1442  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  38.82 
 
 		 291 aa  50.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 213 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.21 
 
 		 901 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  34.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  29.91 
 
 		 944 aa  48.9  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  21.99 
 
 		 901 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  43.08 
 
 		 271 aa  48.9  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.37 
 
 		 922 aa  48.5  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.33 
 
 		 1383 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 212 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  23.35 
 
 		 913 aa  48.5  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  45.16 
 
 		 213 aa  48.5  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  42.03 
 
 		 285 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 225 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  21.99 
 
 		 901 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  21.99 
 
 		 901 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  21.99 
 
 		 901 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  21.99 
 
 		 902 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 218 aa  47.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.46 
 
 		 876 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.5 
 
 		 1003 aa  47.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.73 
 
 		 1111 aa  47.8  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  44.29 
 
 		 242 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  24.22 
 
 		 891 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  27.4 
 
 		 1094 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.9 
 
 		 880 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  21.61 
 
 		 1082 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  49.09 
 
 		 1204 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.37 
 
 		 1019 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 210 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  22.08 
 
 		 935 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 210 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.18 
 
 		 907 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 904 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 241 aa  46.2  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 221 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 221 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2536  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.15 
 
 		 216 aa  45.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 221 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 221 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 206 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  24.7 
 
 		 695 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 947 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3086  LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 226 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 219 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 248 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.9 
 
 		 925 aa  45.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 216 aa  45.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  39.68 
 
 		 895 aa  44.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.41 
 
 		 947 aa  44.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 222 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 204 aa  44.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>