More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3086 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3086  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.74 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  44.74 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 496 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2232  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.53 
 
 		 867 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0572  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  27.66 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3118  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.47 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5839  two component LuxR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.242407  hitchhiker  0.00194364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  44.3 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  32.91 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0187  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2626  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.390788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1452  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2699  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  40.3 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.03 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  45.31 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 497 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2354  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.96 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1684  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.7 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  37.37 
 
 		 862 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2039  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  39.51 
 
 		 541 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 904 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  40.3 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  45.9 
 
 		 1006 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  43.08 
 
 		 913 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.62 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>