More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2317 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  46.03 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.82 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  45.9 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.64 
 
 		 867 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3086  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.02 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 506 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 500 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 954 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  34.94 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  43.08 
 
 		 914 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 911 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.89 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.77 
 
 		 905 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3512  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.492486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  37.84 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  40.91 
 
 		 891 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 905 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 905 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.16 
 
 		 905 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1706  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 827 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 207 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 906 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 		 827 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 970 aa  52.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 224 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 		 592 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5271  transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.1 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0244  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.55 
 
 		 876 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 906 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 781 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  39.34 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  45.9 
 
 		 920 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  37.14 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 539 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2506  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 910 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>