278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0244 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0244  response regulator receiver protein  100 
 
 		 247 aa  510  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0339  transcriptional regulator, LuxR family  57.83 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.0558568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0307  transcriptional regulator, LuxR family  57.39 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4065  transcriptional regulator LuxR family  53.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  36.93 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  34.09 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  37.93 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  31.5 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  33.76 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  44.78 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  29.14 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3118  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  25.42 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  46.77 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  28.33 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  38.57 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  42.19 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  27.22 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.72 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  31.96 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  45.9 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  28.46 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  40.62 
 
 		 891 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4356  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0940  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 905 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  31.46 
 
 		 905 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 118 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 500 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  44.26 
 
 		 232 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.5 
 
 		 905 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 123 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 		 267 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  25.61 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0694  transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  42.62 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>