More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0119 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  99.61 
 
 
268 aa  537  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  78.85 
 
 
260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  27.24 
 
 
241 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  27.24 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  31.58 
 
 
236 aa  79  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  28.38 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  32.61 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  31.28 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.65 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.65 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.65 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.65 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  27.63 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  30.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  30.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.09 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.63 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  28.22 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  27.14 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  28.27 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.27 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.75 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  27.14 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.75 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  29.27 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  29.27 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.58 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.58 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.58 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  28.76 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  26.83 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.75 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.94 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  44.05 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  26.77 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  54.69 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.6 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  27.6 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.02 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  47.14 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  28.42 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  27.75 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  29.85 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.92 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  34.88 
 
 
248 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.92 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.92 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>