More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  98.99 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.23 
 
 		 198 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.99 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 253 aa  157  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.95 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.5 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  37.56 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  35.71 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  68.67 
 
 		 268 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.22 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  80.3 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.77 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  31.43 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  34.63 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  28.85 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  32.39 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.55 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.72 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 230 aa  101  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 228 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 		 239 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4745  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.33 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  33.49 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 		 231 aa  99  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 235 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  98.6  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 239 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 223 aa  98.6  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.86 
 
 		 215 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 219 aa  97.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.49 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 254 aa  97.8  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>