More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4439 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 257 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  34.63 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.68 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 292 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 259 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  31.51 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  34.94 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 246 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  32.86 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  35.45 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  32.37 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  34.1 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 303 aa  89.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  30.6 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.31 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.64 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.98 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  34.74 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  34.78 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  29.21 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  29.89 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.53 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>