More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0190 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  68.27 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.32 
 
 		 226 aa  277  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  69.85 
 
 		 214 aa  274  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  67.84 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.7 
 
 		 223 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.39 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.56 
 
 		 218 aa  261  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  62.32 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  62.32 
 
 		 212 aa  257  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  63.11 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 213 aa  254  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  63.16 
 
 		 223 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  62.98 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 231 aa  252  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 211 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.68 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.08 
 
 		 222 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  60.39 
 
 		 216 aa  247  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  59.43 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 212 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  59.91 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  59.91 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.74 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.94 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.81 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.29 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 216 aa  231  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.87 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.05 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  58.77 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.5 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.81 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.49 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.81 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.93 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 253 aa  161  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  43.6 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1701  response regulator receiver protein  44.06 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0169479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.47 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  40.89 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>