More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0548 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
244 aa  506  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  93.03 
 
 
244 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  54.78 
 
 
230 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  45.09 
 
 
246 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  44.44 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
240 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  32.75 
 
 
241 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 
241 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
248 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  31.06 
 
 
247 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
248 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  28.27 
 
 
245 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 
243 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  32.51 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  41.73 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  32.62 
 
 
251 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
242 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  29.95 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  28.39 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0339  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.0558568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0307  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  29.15 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  28.88 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0244  response regulator receiver protein  44.76 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4065  transcriptional regulator LuxR family  58.46 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  30.96 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  25.73 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  38.68 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  27.32 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  29.65 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  27.92 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  29.71 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  53.12 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  26.84 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  26.98 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.96 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.96 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.96 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.96 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.96 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  27.52 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.96 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  35.43 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.69 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4715  two component LuxR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  29.65 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  30.16 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.83 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.83 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.83 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.83 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.83 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.83 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.83 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  50.79 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  25.67 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  50.82 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  50.82 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  50.82 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  50.82 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  50.82 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>