More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4514 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  99.59 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  93.42 
 
 		 243 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  36.59 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  33.74 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  29.48 
 
 		 307 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  34.47 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  34.81 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  36.21 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  27.2 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  26.97 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  27.94 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 276 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.41 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.41 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.41 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.41 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  29.05 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  28.25 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  28.25 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  30.16 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  28.27 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.16 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.31 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.31 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  30.53 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.31 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.31 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.31 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  27.47 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5493  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.31 
 
 		 394 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.1 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  28.35 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  28.35 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  26.84 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>