More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2087 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 425 aa  852    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  84.37 
 
 		 394 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  97.9 
 
 		 238 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  97.9 
 
 		 238 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  97.9 
 
 		 238 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  97.9 
 
 		 238 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  97.9 
 
 		 238 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 244 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 237 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 237 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  36.05 
 
 		 236 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  32.52 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  36.6 
 
 		 248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 237 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 237 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  34.21 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.21 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  34.21 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.21 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.21 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.21 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.21 
 
 		 239 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.21 
 
 		 239 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  35.79 
 
 		 254 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  33.18 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  37.3 
 
 		 247 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 239 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  33.65 
 
 		 239 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 234 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 229 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 237 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  37.63 
 
 		 234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 239 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 239 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 248 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 239 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 235 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 235 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 242 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 243 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  34.23 
 
 		 248 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 247 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  32.62 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 242 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  31.6 
 
 		 213 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.83 
 
 		 241 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 241 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 237 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 237 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 241 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 241 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 241 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 237 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 		 236 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.49 
 
 		 234 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  33.49 
 
 		 234 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.49 
 
 		 236 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  28.75 
 
 		 245 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 230 aa  99.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 228 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 246 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 242 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  32.74 
 
 		 224 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 246 aa  96.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 248 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 248 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 		 206 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  32.74 
 
 		 241 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4647  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 279 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.16 
 
 		 234 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  30.49 
 
 		 240 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 242 aa  93.2  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  27.39 
 
 		 245 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 235 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  31.06 
 
 		 240 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  31.06 
 
 		 233 aa  91.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>