More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3098 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 254 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  34.22 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  27.38 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.6 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.6 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.6 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.6 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.6 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.27 
 
 		 425 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  29.61 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.6 
 
 		 394 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.89 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  33.89 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.89 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  33.89 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.89 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.89 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.89 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.03 
 
 		 239 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  30.43 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  32.45 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  30.37 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  28.29 
 
 		 237 aa  98.6  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  30.19 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 231 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  29.39 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  35.38 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  26.34 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  29.39 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.2 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  32.74 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  30.13 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  31.27 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  27.41 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  28.16 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.16 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.16 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  26.36 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.75 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.75 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>