More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_2024 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  100 
 
 
230 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  96.09 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
321 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 
206 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
242 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
244 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
242 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
260 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  31.67 
 
 
242 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 
425 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  30.57 
 
 
307 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.8 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
394 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
276 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 
237 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  35.52 
 
 
237 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  32.24 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  30.41 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  30.89 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  31.69 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  29.39 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
248 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  29.86 
 
 
250 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
248 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  28.76 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 
265 aa  85.5  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 
243 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
243 aa  85.1  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  28.95 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.76 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  28.76 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.76 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  28.19 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  32.31 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  28.76 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  26.91 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  32.38 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.97 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  32.98 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  26.23 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  30.57 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  31.56 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  27.04 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  30.73 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  29.1 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  29.19 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  27.68 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>