More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5462 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  88.52 
 
 		 244 aa  435  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  42.97 
 
 		 243 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  43.37 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  32.1 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  38.38 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  32.63 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  28.72 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  29.74 
 
 		 307 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 321 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  31.89 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.45 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  27.86 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5493  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9195  transcriptional regulator TraR  28.5 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.391185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  24.17 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  29.57 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  29.57 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  25.35 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  25.81 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  25.35 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  29.08 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2588  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  29.08 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.81 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.81 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4428  transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0066  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.961932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5387  autoinducer-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.841269  normal  0.0379322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.81 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  30.81 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.53 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.53 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.53 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.53 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.53 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.53 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  29.9 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  30.98 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  28.51 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.53 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>