More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  43.83 
 
 		 234 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  31.15 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  33.47 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  32.14 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  28.98 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  20.76 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  29.6 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  26.56 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  29.02 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  29.03 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  62.71 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  62.71 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  27.76 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  27.85 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  35.2 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  30.69 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  27.85 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  34 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  30.45 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  26.06 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  30.45 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  25.63 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.63 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.63 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  25.63 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.52 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.63 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.63 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.63 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  27.4 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 242 aa  62  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  27.32 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  34.17 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  28.07 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  27.05 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  24.79 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  43.24 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  28.46 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.8 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  50 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  25.6 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0670  regulatory protein LuxR  39.73 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2959  salavaricin two-component response regulator  32.39 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>