269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1935 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  25.21 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.26 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1550  putative regulatory protein  29.52 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  28.96 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  27.75 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  37.59 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.83 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.83 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.83 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  26.83 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.79 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.79 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.79 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.79 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.79 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.79 
 
 		 394 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.51 
 
 		 425 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  27.43 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.98 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  22.27 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.43 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.52 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  25.23 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  27.48 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  31.35 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  24.34 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  27.69 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  23.74 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  27.72 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2179  LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3724  response regulator receiver protein  28.4 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.954342  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  37.5 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  25.48 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  25.33 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  41.56 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  26.32 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  28.19 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  32.03 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0694  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.49 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.49 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>