More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2507 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  56.64 
 
 		 234 aa  262  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49700  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  34.32 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  31.01 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  29.77 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  29.17 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  28.25 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  27.68 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  30.36 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  24.02 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  25.99 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  32.37 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  28.07 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  27.59 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  28.49 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  26.79 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.78 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  26.59 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  30.95 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  34.18 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  32.09 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.01 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  29.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  29.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  27.32 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  29.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  29.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  29.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  29.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  29.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  29.31 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1231  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0698119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 361 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.17 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.17 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  35.24 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.17 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.17 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  26.78 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.17 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  35.24 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>