More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1407 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  45.81 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  33.01 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  33.01 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  33.01 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.01 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  26.98 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  30.11 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  31.72 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  28.81 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  31.32 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.41 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.41 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.41 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.86 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.41 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  27.9 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.41 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.41 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  28.71 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1709  transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  28.81 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  26.47 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4889  autoinducer-binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70592  normal  0.843155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.14 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  26.25 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  30.34 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  27.95 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  28.73 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5387  autoinducer-binding domain-containing protein  25.55 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.841269  normal  0.0379322 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  27.17 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.22 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4647  LuxR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  25.69 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  26.29 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>