More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2120 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
244 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2116  LuxR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.6 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.6 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.6 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.6 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.6 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.6 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.6 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  47.95 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  36.15 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  47.76 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  47.76 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.76 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.76 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.88 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.76 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.76 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  47.76 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  42.03 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  35.82 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4045  LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  36.63 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  32.5 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  24.31 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0339  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.0558568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0244  response regulator receiver protein  28.87 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0307  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4720  putative PAS/PAC sensor protein  45.9 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104323  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  45.9 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  37.08 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  29.61 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  27.23 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  30.12 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  34.68 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  23.37 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  32.12 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  29.41 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4889  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672367  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.57 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  26.18 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  25 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  42.62 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.44 
 
 
901 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  41.27 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4356  response regulator receiver protein  37.23 
 
 
195 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3512  regulatory protein, LuxR  37.78 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.492486  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.82 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.82 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  41.54 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.98 
 
 
921 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.98 
 
 
921 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.98 
 
 
921 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.82 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.82 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>