More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1362 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
257 aa  507  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3779  regulatory protein, LuxR  47.15 
 
 
248 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3549  regulatory protein, LuxR  36.11 
 
 
255 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1997  regulatory protein, LuxR  35.59 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  38.35 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  29.44 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.52 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  29.27 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  45.24 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.64 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.64 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.64 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.64 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.64 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  32.61 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.07 
 
 
394 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.43 
 
 
425 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0119  LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0110  LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.514691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4224  regulatory protein LuxR  50.68 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  31.38 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  31.38 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  31.38 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  51.67 
 
 
201 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  25 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  46.77 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.65 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.65 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  45.16 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  50 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.65 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  45.9 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  49.21 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  25 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  48.39 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.65 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.19 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.19 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.65 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.19 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.19 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.19 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 
240 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.09 
 
 
240 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  27.93 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  45.16 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1672  regulatory protein LuxR  26.45 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.793356  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  44.59 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  31.21 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  40 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  33.11 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  24.15 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.12 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.12 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2120  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0535979  normal  0.194929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4647  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  45.9 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  40 
 
 
235 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>