More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2681 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  100 
 
 		 262 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0166  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1374  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0165  LuxR family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 79 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2265  LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  30.41 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1975  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.16 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  51.85 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1362  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  47.46 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 1021 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3402  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.511462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  41.67 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3665  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.24 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.24 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.24 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1895  putative transcription regulator protein  29.1 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.030885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.97 
 
 		 922 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.75 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  41.56 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0448  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00573595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1795  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0488628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.66 
 
 		 867 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1334  putative DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 161 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1094  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000582737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1325  putative DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0852238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1165  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0704  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000213253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1471  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  44.23 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  45.76 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.78 
 
 		 1019 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  40.24 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>