More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4851 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  46.64 
 
 		 256 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  42.39 
 
 		 235 aa  175  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.33 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  28.19 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5235  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183919  normal  0.452557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1473  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  35.42 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  40 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 421 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  47.27 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  41.94 
 
 		 911 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  42.19 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.4 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.89 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5412  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 155 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.221863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  48 
 
 		 399 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  41.51 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  42.67 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 896 aa  51.6  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.8 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 927 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  38.96 
 
 		 943 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  41.51 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  33.75 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.63 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0348  putative GAF sensor protein  37.21 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0966  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4314  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3915  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.0598624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0610  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.61 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1953  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  36.51 
 
 		 823 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 542 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  44.83 
 
 		 923 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>